Nature-Skills的教程

一、Nature-Skills 是什么？

Nature-Skills 是集成在 Claude Code 中的一套科研学术写作专用 Agent 工具箱。它由 9 个功能各异的子 Agent 组成，分别对应学术发表的不同阶段：

简单来说，它们就像是你的专属科研助理团队——有文献检索员、写作助手、语言编辑、图表设计师、PPT 制作师和审稿沟通专家。你只需要用自然语言描述需求，对应的 Agent 就会调用专业工具来完成任务。

如何安装免除，后面介绍主要功能。

01nature-writing — 论文写作助手

能力：根据你的研究数据、图表结果或中文草稿，直接撰写 Nature 风格的论文各章节。
适用对象：所有需要撰写英文学术论文的研究人员

# 撰写引言我研究的是 CRISPR 在植物基因编辑中的应用， 已有 A、B、C 三个关键实验结果。 请用 nature-writing 撰写 Introduction 部分， 突出当前研究的 gap 和我们的创新点。# 撰写 Discussion基于以下结果：[粘贴结果概要] 请用 nature-writing 帮我撰写 Discussion， 解释结果意义，指出局限性，并提出未来方向。

使用技巧：提供的信息越具体，写作质量越高。建议将图表、数据总结、关键文献一并提供。Agent 会主动查询你提到的文献来确保引用的准确性。

02nature-polishing — 语言润色专家

能力：润色、重写或翻译学术英文，将普通学术英语提升至 Nature 级别的语言标准。
适用对象：英文写作经验不足、希望提升稿件语言质量的研究者

三种工作模式

润色模式：在保留原意的基础上优化语法、用词和句式
重写模式：对表达不佳的段落进行大幅重组，提升逻辑流畅性
翻译模式：将中文草稿翻译为地道的英文学术表达

# 模式一：英文润色请用 nature-polishing 润色以下段落（保持原意，提升语言质量）： [粘贴英文段落]# 模式二：中译英请用 nature-polishing 将以下中文翻译为 Nature 风格的英文： [粘贴中文内容]# 模式三：指定改进方向请用 nature-polishing 润色这段文字，我希望： 1. 句式更简洁 2. 被动语态改为主动语态 3. 增加学术短语的多样性

使用技巧：润色时可以指定具体需求（如”请改为更正式的学术风格””请缩短句子长度”），Agent 会根据要求调整策略。多次迭代润色效果更佳。

03nature-citation — 参考文献管理

能力：从 DOI、PMID、arXiv ID 或 URL 自动获取文献元数据，生成 .bib、.ris、.nbib 等多种引用格式，并可自动核实引文准确性。
适用对象：正在撰写论文、需要管理大量参考文献的研究者

# 从文献ID生成引用请用 nature-citation 从以下 DOI 生成 BibTeX 引用： 10.1038/s41586-023-06415-0 10.1126/science.abf1234# 核实引文请用 nature-citation 核实以下参考文献信息： Zhang et al., Nature 2023, "CRISPR-based genome editing"# 导出 EndNote 兼容格式请用 nature-citation 将这些文献导出为 .ris 格式

注意：引文数据来源于公开数据库，对于一些较新或未被广泛收录的文献，建议手动核对关键信息（作者、卷号、页码）。

04nature-figure — 科研图表制作

能力：使用 Python 或 R 自动生成符合 Nature 投稿标准的科研图表，支持多面板组合图、统计可视化，输出 SVG/PDF/TIFF 等格式。
适用对象：需要制作投稿级图表的研究人员

# 从数据生成图表我有以下数据 [粘贴 CSV 数据或描述数据结构]， 请用 nature-figure 制作一张多面板 Figure， 包含箱线图、散点图和热图，输出为 300 DPI TIFF 格式# 修改已有图表请用 nature-figure 修改当前图表： - 将配色方案改为 Nature 推荐的色盲友好配色 - 统一字体为 Arial - 增加统计显著性标注

使用技巧：Nature-figure 遵循 Nature 期刊的图表规范，包括字体、字号、线条粗细、配色方案等。你可以指定具体的期刊要求，Agent 会自动调整样式。

05nature-reader — 文献精读助手

能力：从 PDF、DOI、arXiv 或 URL 中提取论文内容，生成中英对照的精读笔记，图表与文字对应展示。
适用对象：需要深度阅读文献、准备组会汇报的研究生和科研人员

# 通过DOI阅读论文请用 nature-reader 帮我精读这篇论文： https://doi.org/10.1038/s41586-024-07234-7 需要中英对照，标注关键图表# 通过PDF阅读请用 nature-reader 阅读这个 PDF，生成带图表的精读笔记： [拖拽PDF文件到会话中]# 阅读本地PDF请用 nature-reader 阅读 /path/to/paper.pdf， 输出中英对照版精读笔记， 重点关注 Methods 和 Results 部分

使用技巧：你可以要求针对特定章节精读（如 “只精读 Methods 部分”），或要求输出特定格式的笔记（Markdown、思维导图格式等）。

06nature-response — 审稿回复信生成

能力：根据审稿意见和你的修改方案，逐条起草点对点的审稿回复信。
适用对象：收到审稿意见、正在准备修改稿的研究人员

# 基于审稿意见生成回复请用 nature-response 帮我回复以下审稿意见：  审稿人意见1：样本量太小，结论不可靠 我们的修改：补充了10个额外样本，重新分析结果一致 请帮我起草回复# 批量生成请用 nature-response 针对这3条审稿意见， 逐条撰写回复信。注意语气要 respectful but confident。

使用技巧：回复时提供以下信息效果最佳：(1) 审稿意见原文；(2) 你做了哪些修改；(3) 修改在论文中的位置（页码、行号）。

07nature-paper2ppt — 论文汇报 PPT

能力：将论文自动转化为中文汇报 PPTX 文件，适用于组会汇报、期刊俱乐部或学术会议展示。
适用对象：需要做论文汇报的研究生和科研人员

# 通过DOI生成PPT请用 nature-paper2ppt 将这篇论文做成汇报PPT： [DOI 或 PDF 文件]# 定制PPT内容请用 nature-paper2ppt 生成组会PPT， 重点突出研究背景和创新点， 背景部分用中文讲解，结果部分保留英文原图

使用技巧：可以指定 PPT 的风格、语言、内容侧重等。生成的 PPTX 文件可进一步手动调整。

08nature-academic-search — 多源学术搜索

能力：同时在 PubMed、arXiv、Crossref 等多个数据库中进行文献检索，支持 MeSH 搜索策略，可导出 .nbib/.ris/.bib 格式。
适用对象：文献调研、系统综述、引文查证的研究人员

# 主题搜索请用 nature-academic-search 搜索 2024-2026 年 关于"single-cell RNA sequencing in tumor microenvironment" 的最新文献，重点关注 Nature 系列期刊# 综合检索（指定多个数据库）请用 nature-academic-search 在 PubMed 和 arXiv 上搜索 "deep learning drug discovery"，每个数据库返回 top 10 结果# MeSH 辅助检索帮我用 nature-academic-search 设计 MeSH 搜索策略， 主题：CRISPR-Cas9 gene therapy for genetic disorders

使用技巧：支持通过 allowed_domains 和 blocked_domains 过滤来源。

09nature-data — 数据可用性声明

能力：生成符合 Nature 系列期刊要求的数据可用性声明，推荐合适的数据仓储库，并提供 FAIR 数据合规性检查。
适用对象：即将投稿、需要准备数据声明的研究人员

# 生成数据声明我的研究涉及以下数据类型： - RNA-seq 数据 (fastq 文件) - 蛋白质质谱数据 - 分析代码 (Python scripts) 请用 nature-data 生成 Data Availability Statement， 并推荐合适的数据库# FAIR 合规检查请用 nature-data 检查我的数据管理计划 是否符合 FAIR 原则

使用技巧：不同期刊对数据可用性声明的要求不同。可以指定目标期刊（如 Nature Genetics、Nature Communications），Agent 会按该期刊的具体要求生成声明。

# 在多个数据库中搜索相关文献请用 nature-academic-search 搜索 2023-2026 年 关于 "single-cell transcriptomics tumor microenvironment immunosuppression" 的最新研究。优先关注 Nature、Cell、Science 系列期刊， 需要导出为 BibTeX 格式。

# 精读关键文献请用 nature-reader 精读以下论文： [DOI 1] [DOI 2] 要求输出中英对照精读笔记， 标注研究设计、关键发现和局限性。

# 撰写 Introduction请用 nature-writing 撰写 Introduction， 背景：肿瘤微环境中免疫抑制的机制尚不完全清楚…… 我们的前期发现：[简要描述结果] 请突出研究 gap 和我们的创新点， 引用 Step 1 中检索到的关键文献。

# 生成 Figure 1我有单细胞 UMAP 坐标数据和细胞注释结果， 请用 nature-figure 绘制 Figure 1， 包含：(a) UMAP 聚类图 (b) 细胞类型 marker 基因表达热图 目标期刊：Nature Communications 输出格式：300 DPI TIFF

# 全文润色请用 nature-polishing 润色我的 Abstract 和 Introduction， 目标：提升学术正式度，使语言达到 Nature Communications 水平。 特别留意被动语态的恰当使用和句子长度的变化。Step 6：准备数据声明

# 生成声明请用 nature-data 生成 Data Availability Statement， 数据类型：scRNA-seq fastq 文件、分析代码 (R/Python) 已上传至 GEO (GSE123456) 和 GitHub 目标期刊：Nature Communications

# 批量生成引用请用 nature-citation 从以下 DOI 批量生成引用， 输出为 BibTeX 格式： [DOI 列表] 并核实作者、年份、期刊信息是否准确。

# 生成汇报PPT请用 nature-paper2ppt 将这篇论文生成组会汇报 PPT， 中英混合风格，突出创新点和方法学亮点。输出为 PPTX 文件。

# 回复审稿意见请用 nature-response 逐条回复以下 3 条审稿意见， 语气专业且自信，说明我们的修改方案： [粘贴审稿意见和修改说明]

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